在国内正规的生殖机构申请捐卵助孕，是不能选择胎儿性别的。原因很简单。为了尊重男女平等，避免一些家庭出现重男轻女的思想，禁止用医学的方法来鉴定胎儿的性别。是的，这包括试管中的性别选择。除非患者有伴性遗传病，那么为了优生优育，可以考虑做三代供卵试管，选择生男孩还是女孩。
供卵助孕是利用第三方的卵子与男方的精子结合受精，经过一段时间的培养，移植到女方的子宫内。但是，供卵助孕目前还不受中国法律的保护，供卵试管婴儿的条件很多，患者必须满足才可以申请。目前国内很多正规的生殖机构都开展了供卵助孕技术，但是不能选择性别，原因如下：
1、法律不允许。在我国早期，重男轻女的家庭很多。为防止部分家庭因生女胎儿而流产，我国禁止使用医学手段鉴定胎儿性别。捐卵助孕不允许选择；
2、捐卵在国内正规的生殖机构辅助受孕，一般做的是第一代和第二代试管婴儿。该技术不检查胚胎染色体，无法得知胚胎性别，不支持选男选女；
3、女性卵子携带xx性染色体，而精子携带xy性染色体，所以决定胎儿性别的不是供卵，而是精子。
虽然在中国是不允许在正规机构使用供卵进行辅助受孕来选择性别的，但是也有特殊情况，比如患有遗传病的患者男传女，那么可以做三代试管婴儿使用捐赠卵子并选择生女孩；如果有遗传病从女性传给男性，那么可以选择生男孩。
